如何在HDF5数据集中存储字典 - python

我有一本字典，其中键是datetime对象，值是整数元组:

>>> d.items()[0]
(datetime.datetime(2012, 4, 5, 23, 30), (14, 1014, 6, 3, 0))

我想将其存储在HDF5数据集中，但是如果我尝试仅转储字典h5py会引发错误:

TypeError:对象dtype dtype('object')没有等效的本机HDF5

将字典转换为HDF5数据集的“最佳”方法是什么？

具体来说，我不想只是将字典转储为numpy数组，因为这会使基于datetime查询的数据检索变得复杂。

参考方案

我发现了两种方法:

I)将日期时间对象转换为字符串并将其用作数据集名称

h = h5py.File('myfile.hdf5')
for k, v in d.items():
    h.create_dataset(k.strftime('%Y-%m-%dT%H:%M:%SZ'), data=np.array(v, dtype=np.int8))

通过查询键字符串(数据集名称)可以访问数据的位置。例如:

for ds in h.keys():
    if '2012-04' in ds:
        print(h[ds].value)

II)将日期时间对象转换为数据集子组

h = h5py.File('myfile.hdf5')
for k, v in d.items():
    h.create_dataset(k.strftime('%Y/%m/%d/%H:%M'), data=np.array(v, dtype=np.int8))

注意strftime字符串中的正斜杠，它将在HDF文件中创建适当的子组。可以像h['2012']['04']['05']['23:30'].value一样直接访问数据，或者通过提供的h5py迭代器进行迭代，甚至可以通过visititems()使用自定义函数来访问数据

为简单起见，我选择第一个选项。

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