为什么在具有相同硬件的不同计算机上读取sqlite数据库速度较慢? - python

好的,所以我正在观察某些我肯定会称之为“意外”的行为,并且我很好奇是否有人可以提供并了解地球上正在发生的事情。我会尽量保持简洁...

我有一个sqlite数据库,我正在使用Python(150k行,11个表)访问该数据库,以进行神经网络训练。两端无关紧要,但这意味着我的数据点以较大的blob的形式存储在一个表中,并且数据库大约为5GB。因为我只提取某些行(由于交叉验证或其他类型的过滤),所以我发现在某些有意义的列上建立索引可以显着提高速度。当阳光明媚时,我可以在2秒钟左右选择,获取并格式化大约500个数据点。这很棒。

但是,正如熟悉神经网络/反向传播软件/ SGD的任何人都可以证明的那样,根据数据和架构的不同,此过程可能会花费很长时间。为了使事情达到最佳并行化,我已购置了多台机器(Mac Pro,8GB RAM,16个知道速度的内核),以便在不同条件下以不同线程启动训练方案。由于内存的限制,上限大约是6或7个独立的线程,每个线程都访问同一数据库文件。现在,据我所知,这些机器是相同的。

这就是奇怪的地方。最初,我的基准计算机上的性能非常出色,并且并行线程数从未使速度变慢(一个线程与七个线程基本相等)。当我第一次将此数据库文件复制到其他计算机(并重新创建索引)时,一个速度与基准速度相同,但另一个速度则比基准速度快两倍。我当时(当时)认为这是硬件差异,然后继续生活。然后,修改了sqlite数据库并重新复制到所有计算机后,它现在在以前速度较慢的计算机上速度很快,而所有其他计算机的性能(包括基准)则较慢。

我不明白我对所有实例都做了同样的事情。数据库文件在复制时是相同的,然后删除/创建相同的索引,因为我敢肯定sqlite索引是指磁盘上的绝对位置。我在Unix环境中,因此文件碎片不应该成为罪魁祸首(对吗?)。并发在某些配置中似乎不是问题,而其他配置则会导致瓶颈。从那以后我检查了一下,发现机器实际上在纸上是一样的。对我来说,最令人困惑的部分是,在一台机器的配置中性能是不同的。

我真的很茫然。任何方向都将不胜感激。我绝不是精通关系数据库编程,但是在这一点上我没有想法。

更新:我可能已经“解决”了我的问题,但是这个问题绝没有得到解决。我发现,如果我基本上在每个系统上重新启动数据库文件,则最终可以使机器之间的性能相同。该过程类似于...

    while unhappy:
 1. Drop all indexes
 2. Create new indexes
 3. Make a handful of select/fetch calls
 4. Commit / quit / restart

一段时间后,它似乎可以使人满意。不知道为什么。

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