h5py无法将元素0转换为hsize_t - python

我在hdf5-文件中有大量图像，我想加载和分析这些图像。每个图像都是1920x1920 uint16，然后将它们全部加载到内存中会使计算机崩溃。有人告诉我，其他人可以通过切片图像来解决此问题，例如如果数据是1920x1920x100（100张图像），则它们读取每个图像的前80行并分析该切片，然后移至下一个切片。我可以毫无问题地做到这一点，但是当我尝试在hdf5文件中创建数据集时，它会收到TypeError：无法将元素0 ...转换为hsize_t

我可以使用以下非常简化的代码来重新创建问题：

with h5py.File('h5file.hdf5','w') as f:
    data = np.random.randint(100, size=(15,15,20))
    data_set = f.create_dataset('data', data, dtype='uint16') 

它给出了输出：

TypeError: Can't convert element 0 ([[29 50 75...4 50 28 36 13 72]]) to hsize_t 

我也尝试省略“ data_set =”和“ dtype ='uint16'”，但仍然出现相同的错误。代码如下：

with h5py.File('h5file.hdf5','w') as f:
    data = np.random.randint(100, size=(15,15,20))
    f.create_dataset('data', data) 

谁能给我任何有关问题所在的提示？
干杯!

参考方案

create_dataset的第二个参数是shape参数（请参见docs），但是您传递了整个数组。如果要使用现有数组初始化数据集，则必须使用data关键字进行指定，如下所示：

data_set = f.create_dataset('data', data=data, dtype="uint16") 

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